金針菇有白色和黃色兩個品種，分冷庫和自然栽培兩種方式。黃色品種的優(yōu)質(zhì)金針菇顏色，應(yīng)為淡黃至黃褐色，菌蓋中央較邊緣稍深，菌柄上淺下深；而白色品種的優(yōu)質(zhì)金針菇，則應(yīng)是白色或乳白色。

黃金針菇和白金針菇的區(qū)別主要有有品種不同、顏色不同兩個方面。

黃色種菌蓋黃色至淺黃色，菌蓋較大，一般1至2厘米，菌柄褐色或深褐色且粗壯挺拔。這類品種子實體形成個數(shù)相對較少，但均勻整齊，產(chǎn)量高，抗逆性強。白色種俗稱白色金針菇，其色澤純白，很適合鮮食，營養(yǎng)價值高、價格也高。

白色種菌蓋白色，菌柄細(xì)且柔韌，菌蓋小到中等，菌柄白色，基部常有絨毛，菌柄較長，子實體個數(shù)較多，不易開傘。這類品種幾乎都引自日本，多數(shù)白色種產(chǎn)量相對較低，較黃色種和淺色低20％左右。白色種由黃色或淺色種突變而來，在長期的營養(yǎng)生長中發(fā)生突變的頻率也較高，變異也很快，因此，退化的發(fā)生較前兩類品種快，這也正是許多菇農(nóng)使用來源不清的白色種產(chǎn)量低的重要原因。

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